Primero buscar la factura a la que se le quiere aplicar el recibo en los comprobantes emitidos.
Luego seleccionarla, y con el botón “Crear recibo” luego del Ok, queda creado por el monto total, y la forma de saber que es un recibo es cuando queda marcada la opción en la columna “Cobranza”

Con esto ya estaría emitido por el monto total.
Para realizarlo por un monto parcial debe ir a Crear nuevo CFE (como cuando se hace una factura)
En la opción Cobranza propia, seleccionar la misma opción
Y agregar datos de la factura original, motivo, serie, numero, fecha del CFE, y la fecha de emisión si corresponde también se puede modificar

Completar con los datos y en el módulo “Detalles”, en indicador de facturación, seleccionar la opción “No facturable”
Agregar la línea y verificar que los montos estén correctos antes de emitir la factura.

Por ultimo, después de verificar los importes, le da siguiente y finalizar, con esto ya aparecería en los comprobantes emitidos el recibo.